قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية

تحقيق التميزفي مجال البيولوجيا الجزيئية والهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية وأبحاث التكنولوجيا الحيوية النانوية القابلة للتطبيق لتوليد المعرفة لصالح المجتمع

تتمثل رسالة قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية في تعظيم الإستفادة من وسائل وأدوات العلوم الحيوية والتكنولوجيا الحيوية والنانو تكنولوجي ونقل تلك العلوم والتقنيات للمجتمع، وذلك من خلال كون القسم مركزاً متميزاً للبحوث والتدريب والخدمات عديدة التخصص، ويكون القسم منارة لنشر التكنولوجيا الحيوية وتطبيقاتها لصالح المجتمع وصحة الإنسان، و ذلك من خلال التعلم المستمر لتعزيز المعرفة والمهارات ذات القيمة لأعضاء القسم.

أ.د./إيهاب الضبع محمد صبري (كيمياء حيوية)

البريد إلكتروني: [email protected]، [email protected]

رؤساء القسم السابقون

أ.د./محمد علي صابر، دكتوراه. & CSc. (الكيمياء الحيوية) أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د. / هناء المحمدي إبراهيم حماد، دكتوراه (كيمياء حيوية)  أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د./محمود حسن معاذ رميح، دكتوراه (كيمياء حيوية)  أستاذ متفرغ  البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د./حنان عبد المنعم عبد الحميد عمر، دكتوراه (كيمياء حيوية) أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د./إيهاب الضبع محمد صبري (كيمياء حيوية) أستاذ البريد إلكتروني: [email protected]، [email protected]
أ.د.محمد عباس شميس استاذ الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية البريد الإلكتروني: [email protected] محمول: 01001651842

أعضاء القسم

أ.د./محمد علي صابر، دكتوراه. & CSc. (الكيمياء الحيوية) أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د. / هناء المحمدي إبراهيم حماد، دكتوراه (كيمياء حيوية)  أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د./محمود حسن معاذ رميح، دكتوراه (كيمياء حيوية)  أستاذ متفرغ  البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د./ هانم محمد أحمد، دكتوراه (كيمياء حيوية)  أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
د./سعاد على محمد شريف، دكتوراه، أستاذ مساعد متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
د./حنان عبد المنعم عبد الحميد عمر، دكتوراه (كيمياء حيوية) أستاذ متفرغ البريد الإلكتروني: [email protected]
أ.د.محمد عباس شميس استاذ الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية البريد الإلكتروني: [email protected] محمول: 01001651842
د./إيهاب الضبع محمد صبري (كيمياء حيوية) أستاذ البريد إلكتروني: [email protected]، [email protected]
د./ منى نجيب عبد النور. دكتوراه (الكيمياء الحيوية) أستاذ مساعد متفرغ البريد الالكتروني: [email protected]
د./ سماح ممدوح، دكتوراه (كيمياء حيوية) أستاذ مساعد البريد الإلكتروني: [email protected]
د./ سامي محمد نصر دكتوراه (ميكروبيولوجي) باحث البريد الإلكتروني: [email protected] [email protected]
د./ هند عكاشة احمد، دكتوراه (كيمياء حيوية) باحث  البريد الإلكتروني: [email protected]
د./ صفية سمير النجار دكتوراه (ميكروبيولوجي) باحث البريد الإلكتروني: [email protected]
أمنية علي محمد، ماجستير (الكيمياء الحيوية)  باحث مساعد البريد الإلكتروني: [email protected]
إيمان منصور ماجستير. ماجستير باحث مساعد البريد الإلكتروني: [email protected]
عبد الله السيد محمد، ماجستير. أخصائي البريد الإلكتروني: [email protected]
أيمن محمد سلام، بكالوريوس. أخصائي البريد الإلكتروني: [email protected]

قسم الكيمياء الحيوية له خبرة طويلة في مجال البيولوجيا الجزيئية منذ عام 1981 ، عندما بدأ الأستاذ الدكتور محمد علي صابر بتطبيق تقنيات البيولوجيا الجزيئية في معمل الكيمياء الحيوية بالمعهد

1- أبحاث البلهارسيا:

المستوى البيوكيميائي والجزيئي: بما في ذلك دراسات أيضية جزيئية  لعائل وطفيل البلهارسيا، وتطوير لقاح الحمض النووي المؤتلف وتوصيف الجينوم

2- أبحاث الكبد:

بما في ذلك الدراسات الجزيئية باستخدام تقنيات التهجين في الموقع والدراسات في نمو الخلايا الكبدية وزراعتها

3-التشخيص الجزيئي وتوصيف مسببات الأمراض المعدية:

التوصيف الجزيئي للبكتيريا المقاومة للأدوية المتعددة وتطوير فحوصات PCR الوقتية  (بما في ذلك HCV و HBV و HPV و CMV و H. Pylori)

4- الإستجابة للعلاج:

• • دراسات علاج الإنترفيرون ومضادات الفيروسات المباشرة لفيروس إلتهاب الكبد C ومسببات الأمراض الأخرى

5- البحث والتطوير لإنتاج المستحضرات الصيدلانية الحيوية المؤتلفة (وحدة الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية ووحدة النانو بيوتكنولوجي):

• • تطوير التعبير المعملي وإنتاج بعض البروتينات العلاجية (إنترفيرون ألفا 2 ب ، إنترفيرون جاما ، IL12 ، هرمون النمو وعامل تحفيز مستعمرة الخلايا الحبيبية)
  • تحسين البحث والتطوير للإنتاج التجريبي للبروتينات المؤتلفة
  • تطبيق تقنية النانو في التشخيص وتوصيل الأدوية (وحدة النانو بيوتكنولوجي)
  • تصميم ، الاقتران الحيوي ، وتوصيف الأنظمة النانوية والميكروية الحاملة (الجسيمات النانوية الغروية ، الكبسولات متعددة الطبقات متعددة الإلكتروليت ، إلخ) لتوصيل الأدوية العلاجية والمواد الوراثية إلى الخلايا المستهدفة
  • إستخدام الجسيمات النانوية لتطوير اختبارات تشخيصية جديدة للكشف عن المؤشرات الحيوية للأمراض ومسببات الأمراض والتطبيقات الحيوية الأخرى

1. تم إجراء بعض الدراسات البيوكيميائية والفيزيولوجية والجزيئية للبلهارسيا على كل من الطفيل و كبد العائل
2. تطوير تقنيات تهجين محددة للكشف عن تسلسلات معينة من DNA / RNA في أنسجة الكبد
3. الدراسات التشخيصية والوبائية الجزيئية على فيروسات التهاب الكبد (B ، C و G) ، فيروس الورم الحليمي ، الفيروس المضخم للخلايا
4. التشخيص الجزيئي والدراسات الوبائية على مسببات الأمراض (السالمونيلا ، هيليكوباكتر بيلوري ، والليستيريا ، إلخ)
5. الدراسات الجزيئية حول استجابة المرضى المصابين بفيروس التهاب الكبد الوبائي للعلاج باستخدام إنترفيرون ألفا المؤتلف
6. الدراسات البيوكيميائية والوبائية والجزيئية لفيروس سي وبي في مصر
7. العزل والتعرف الجزيئي لأربعة جينات من المنشقات (ألدولاز ، فيمبرين ، Sm21.7 ، جلوكوز فوسفات أيزوميراز ،) (www.ncbi.nlm.nih.gov). تم تقييم هذه الجينات باعتبارها مرشحة للقاح البلهارسيا كبروتينات ولقاحات DNA
8. إنشاء مكتبات التعبير عن البلهارسيا المنسونية لمراحل دورة الحياة المختلفة والتي تم استخدامها من قبل العديد من البلدان (موزعة دولياً من خلال “SchistosomeGeneome Project Network” ، www.nhm.ac.uk/hosted_sites/schisto)
9. عزل وتعريف البلهارسيا المنسونية ESTS من خلال المساهمة في مشروع جينوم البلهارسيا (Saber MA، www.ncbi.nlm.nih.gov). تم إيداع أكثر من 1650 من Scistosoma ESTs في GenBank التابع لـ NCBI.
10. عزل الخلايا الكبدية وزرعها في حيوانات التجارب ، إما زرع اصطناعي أو كيميائي. يتم تعديل الخلايا الكبدية مناعياً أو معزولة مناعياً وزُرعت داخل الطحال أو داخل الصفاق ، بعد استحداث فشل كبدي حاد في حيوانات التجارب
11. تحديد الطفرات الجديدة في المنطقة المحددة لجينوم فيروس التهاب الكبد B المعزول من المرضى المصريين السلبيين لـ HBsAb
12. بالتعاون مع المصل واللقاح ، تم تطوير لقاح الحمض النووي المؤتلف للسلالة المصرية من فيروس الحمى القلاعية
13. الدراسات الجزيئية على سلالات البلهارسيا المقاومة للعقار الدوائي البرازيكوانتيل
14. إنتاج الإنترفيرون البشري ألفا 2 ب على نطاق المختبر ، إنترفيرون جاما ، هرمون النمو ، IL2 وعامل تحفيز مستعمرة المحببات
15. دراسة بكتريولوجية وجزيئية لمرض السل الفطري المقاوم للأدوية المتعددة في مصر
16. دراسة دور الكشف عن الحمض النووي البكتيري في تشخيص SBP في المرضى الذين يعانون من تليف الكبد والاستسقاء السلبي
17. تطوير طريقة الكشف السريع عن جرثومة المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين بين مرضى وحدة العناية المركزة
18. دراسة تأثير بروتين مصل شرش اللبن على مرضى التهاب الكبد الوبائي سي
19. تطوير وتقييم لقاحات S. mansoni DNA باستخدام طرق مختلفة للحقن
20. البحث والتطوير لعملية الإنتاج على نطاق تجريبي محدود لـ IFN alpha 2b بما في ذلك تخمير البروتين وتنقيته وفحص النشاط
21. دراسة العوامل الجينية التي تتحكم في استجابة مرضيHCV للعلاج بالإنترفيرون لكل من الفيروس و العائل.
22. تطوير وسائل تشخيصية باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل الوقتي الكمي لاكتشاف فيروس التهاب الكبد الوبائي ب
23. تطوير بروتوكولات لتخليق كبسولات النانو والميكرو لتوصيل الدواء
24. تطوير وسيلة توصيل الأدوية القائمة على تكنولوجيا النانو لعلاج السل المقاوم للأدوية المتعددة
25. تطوير طرق جديدة للكشف المباشر عن الحمض النووي الريبي غير المضخم لفيروس التهاب الكبد الوبائي ج باستخدام جزيئات الذهب النانوية
26. تطوير الفحص اللوني القائم على الجسيمات النانوية الذهبية للكشف المباشر عن الخلايا السرطانية في الكبد والمؤشرات الحيوية
27. توليف بعض الجسيمات النانوية (ذهب ، فضة ، إلخ )
28. أدرج قسم الكيمياء الحيوية كمعمل مرجعي لضبط الجودة للمسح الشامل لوزارة الصحة في عامي 2008 و 2015 لفيروس التهاب الكبد الفيروسي ، التهاب الكبد بي في مصر

عزل الجينات والإستنساخ والتوصيف:

بما في ذلك عزل المواد الوراثية ، تفاعل البلمرة المتسلسل ، تسلسل الحمض النووي ، وضع علامات للحمض النووي وتعديله ، اللطخة الشمالية والبقعة الجنوبية ، التهجين ، بناء مكتبات التعبير الجيني و cDNA ، تطوير ESTs واستنساخ الجينات.

تعبير البروتين المؤتلف:

باستخدام البكتيريا أي كولاي ، والتخمير لإنتاج وتشكيل البروتين الناتج ، الفصل كهربي للبروتين أحادي وثنائي الأبعاد ، تنقية البروتين باستخدام الكروماتوجرافيا والقياس الكمي ، تحليل HPLC ، التركيز الكهروضوئي التحضيري وقياسات الفاعلية .

التوصيف المناعي:

تطوير أجسام مضادة محددة متعددة التكافؤ ، علاج الأمصال ، تنقية IgG ، مكتبات التعبير ، فحص مناعي ، التحليل الكيميائي المناعي للأنسجة وكروماتوجرافيا التقارب المناعي.

زراعة خلايا الكبد والأنواع المختلفة من الخلايا في المختبر وداخل الجسم:

• زراعة خلايا الكبد
•  الأنواع الأخرى من الخلايا للقياسات المضادة للفيروسات ودراسات السمية

المعلوماتية الحيوية:

استرجاع وتحليل تسلسل الحمض النووي والبروتين، والبحث في قواعد البيانات، وتصميم البادئ، و ملاحظة التسلسلات غير المعروفة، وتصميم نماذج الجينات للتعبير عن البروتين المؤتلف في خلايا العائل المختلفة

التشخيص الجزيئي:

• باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل ذو الوقت الفعلي الوقتي للكشف عن العوامل المعدية وتقديرها (انظر الخدمات الروتينية)

تصميم أنظمة متناهية الصغر (النانو والميكرو) لنقل و توصيل الأدوية والمواد الوراثية: (وحدة النانو للتكنولوجيا الحيوية)

 توليف وتوصيف الكبسولات النانوية والميكروية للتوصيل المتحكم فيه للأدوية العلاجية والمواد الوراثية في الخلايا المستهدفة (تخليق الكبسولات  ، تحميل الأدوية ، الإمتصاص الخلوي ، التحقيق في التأثيرات السمية للخلايا للكبسولات على الخلايا ، استقرار البلازما ، إلخ)

استخدام الجسيمات النانوية لتطوير اختبارات تشخيصية جديدة: (وحدة النانو للتكنولوجيا الحيوية)

 للكشف عن المؤشرات الحيوية للأمراض ومسببات الأمراض (تخليق الاجسام النانوية ، توصيفها ).

قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية في معهد تيودور بلهارس للأبحاث مجهز يحتوي علي تجهيزات عديدة لإجراء العديد من التقنيات مثل:

استخلاص الأحماض النووية والمواد الوراثية ، تفاعل البلمرة المتسلسل بأنواعه ، الاستنساخ  الجيني، إستنبات الخلايا، والتعبير عن البروتين ، وتنقية البروتين ، والتوصيف المناعي  والمعلوماتية الحيوية.

في عام 2005 ، تم إنشاء “وحدة التكنولوجيا الحيوية والهندسة الوراثية” لغرض البحث والتطوير في الإنتاج التجريبي للبروتينات. تحتوي هذه الوحدة على أجهزة تخمير، ومعمل لتنقية البروتين وإعادة تشكيله ، ومعمل لزراعة الأنسجة للتقييم البيولوجي لنشاط البروتينات المؤتلفة المنتجة.

كما تم إنشاء وحدة التكنولوجيا الحيوية النانوية في عام 2016 لتعزيز ودعم تطوير أنظمة جديدة للتشخيص وعلاج الأمراض من خلال البحث في أحد أكثر المجالات الواعدة ضمن التطورات التكنولوجية الجديدة: علم النانو.

الأجهزة الرئيسية هي:

1. 1.  التخمير (BioFlo110 ، نيو برونزويك ، الولايات المتحدة الأمريكية)  للخلايا البكتيرية وخلايا الثدييات
   2.  جهاز الطحن الضغط الفرنسي (نيرو)
   3.  جهاز كروماتوجرافي سائل (AKTA Purifier، GE Health Care)
   4.  أجهزة الطرد المركزي فائقة السرعة والتبريد
   5.  جهاز لمعرفة التتابع النيوكليوتيدي للحمض النووي
   6.  جهاز استخراج الحمض النووي وسرعة التفريغ
   7.  PCRالوقتي وأجهزة PCR التقليدية (التدرج ، في الموقع)
   8.  جهاز قياس الطيف الضوئي بتقنية النانو دروب
   9. حاضنات CO2
   10.  خزانات التدفق الصفحي
   11.  أجهزة الفصل الكهربي PAGEG
   12. أجهزة الفصل الكهربي للبروتين ذو البعد واحد وثنائي البعد  وأنظمة النقل
   13.  أنظمة التركيز الكهروضوئية
   14.  أنظمة الكروماتوجراف FPLC
   15.  المجهر المقلوب والفلوري والمجاهر الضوئية
   16.  أجهزة قياس الطيف الضوئي
   17.  ديب فريزر (-20 و -70) وأجهزة التعقيم
   18.  جهاز هزاز
   19.  قارئ ELISA

 قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية في معهد تيودور بلهارس يقوم بعقد  العديد من ورش العمل التدريبية على المستوي المحلي والدولي  في جوانب مختلفة من البيولوجيا الجزيئية والتكنولوجيا الحيوية وعلم الأحياء

1. مبادئ البيولوجيا الجزيئية
2. التشخيص الجزيئي للأمراض المعدية
3. التشخيص الجنائي الجزيئي
4. تفاعل البلمرة المتسلسل بأنواعه
5. تقنيات النانوبيوتكنولوجي
6. التعبير البروتيني المؤتلف في أنظمة ال Coli
7. بالتعاون مع الجامعات ، تم إجراء مشاريع بحث تخرج مميزة في قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية

علي مدار مايقرب من ثلاثين عاما قدم قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية الخدمات  التشخيصية في مجالات الكشف عن  مسببات الأمراض باستخدام تقنيات البيولوجيا الجزيئية للمرضى الداخليين والخارجيين (انظر خدمات المرضى الروتينية والخارجية).

كما يقدم القسم الخدمات العلمية الآتية لمجتمع البحث العلمي :

1. 1.  إستخلاص المادة الوراثية
   2.  تصميم البادئات وتحليل تفاعل البلمرة المتسلسل
   3.  الفصل الكهربائي للحمض النووي والبروتين
   4.  عزل الجينات والاستنساخ وتعبير البروتين وتنقيته  
   5.  تقصي السمية الخلوية للجسيمات النانوية والأدوية والمركبات

تخدم وحدة التشخيص الجزيئي في قسم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية التشخيص الجزيئي لفيروسات التهاب الكبد والفيروسات الأخرى، بالإضافة إلى البكتيريا المسببة للأمراض، باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR)، تفاعل البلمرة المتسلسل الوقتي الحقيقي، التهجين العكسي وتقنيات أخرى للاختبارات النوعية والكمية داخل وخارج المرضى، الاختبارات التالية متاحة

1-HCV-RNA (كمي)
2-HCV-RNA (نوعي)
3-HCV-RNA اختبار ثلاثي
4-IL28 المتغيرات الجينية
5- متغيرات IL4
6- التنميط الجيني HCV
7- HBV-DNA بواسطة PCR (كمي)
8- HBV-DNA بواسطة PCR (نوعي)
9- HGV-RNA بواسطة PCR (جودة)
10- CMV-DNA بواسطة PCR (نوعي)
11-TB-DNA بواسطة PCR (نوعي)
12- H. pylori بواسطة PCR
13-التليف الكيسي بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل
14- كروموسوم فيلادلفيا بواسطة PCR (نوعي)

Internal projects:

1. 1. TBRI: ID 80 ش Development of real time PCR assay for detection of hepatitis B virus. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis

   2. TBRI ID 16ك: The role of microRNA as a diagnostic biomarker in bladder cancer Egyptian patients.(2016) PI: Dr. Samah Mamdouh.

   3. TBRI: Microsatellite instability in hepatocellular carcinoma associated with hepatitis C virus infection in Egyptian patients.(2015) PI: Dr. Samah Mamdouh.

   4. TBRI ID 16ك (2014): Biochemical studies on purified recombinant interferon gamma produced in E. coli

   5. TBRI: ID 1 (innovative research). (2008-2012) Optimization of expression and activity of interferon alfa-2b produced in E. coli. PI: Professor Dr Ehab El-Dabaa

External projects:

1. 6. Academy of Scientific Research and Technology (2020): Development and Validation of a National Diagnostic Assay for Rapid Detection of COVID19. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   7. Academy of Scientific Research and Technology (2018-2020): “Scaling-up, Production & commercialization of Real Time-PCR kit for HBV diagnosis”. . PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   8. STDF, ID: 25901 (2018): “Long Non-Coding RNA: An Innovative Therapeutic Tool for Hepatocellular Carcinoma in vitro and in vivo”. PI: Prof. Dr. Eman El Ahwany.

   9. STDF, ID: 27797 (2018): “Polymer Nanoparticle Mediated Delivery of MicroRNA: A Novel Potential Therapeutic Tool for Hepatocellular Carcinoma in an Experimental Model”. PI: Professor Dr Eman El Ahwany.

   10. STDF – DAAD (2017): “Assessment of potential synergistic or antagonistic toxicity mechanisms during co-exposition of in vitro models towards cerium dioxide nanoparticles and environmental chemicals/pharmaceuticals“. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   11. AECID, Spain: Development of Gold Nanoparticle-Based Colorimetric Assay for the Direct Detection of liver Cancerous Cells and biomarkers”. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   12. Ministry of Scientific Research `Egypt` & National Research Foundation `South Africa,` ID17-2-12: ’Nanotechnology-based drug delivery for treatment of multi-drug-resistant tuberculosis. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   13. STDF-DAAD: Multilayer Polyelectrolyte Microcapsules: a Novel Tool for Controlled Delivery of Interferon-alpha in Chronic HCV Infected Patients. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis.

   14. ASRT Strategy ID (2014-2017). Scalling up of production of recombinant human interferon Gamma in prokaryotic system. PI: Professor Dr Mohamed Ali Saber

   15. ASRT (2014-2016): Development of a Novel Assay for Direct Quantification of Unamplified Hepatitis C Virus RNA Using Gold Nanoparticles and Catalytic Signal Amplification’’. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis

   16. STDF – STF ID 6080. (2013-2016) ”Biochemical and Biophysical studies on recombinant human growth hormone expressed in a prokaryotic system”. Assistant Researcher Sami Mohamed Nasr

   17. Ministry of scientific research &NRF `South Africa: ID17 (2012-) :”Nanotechnology-based drug delivery for treatment of multi-drug-resistant tuberculosis’’. PI: Professor Dr Mohamed Abbas Shemis

   18. STDF ID 1454. Development of production and pegylation of interferon alph Principle investigator: Professor Dr Ehab El-Dabaa. 2010 -2014.

   19. STDF Egypt ID 1763 (2010-2014) Impact of interferon alpha-2 alleles and anti-interferon alpha-2 antibodies in HCV infected patients as predictive factors for response to interferon therapy. PI: Professor Dr Mohamed Ali Saber.

2020

1. 1. Lesego L. Tshweuab, Mohamed A. Shemis, Aya Abdelghanyc, Abdullah Goudac, Lynne A. Pilcher, Nicole R. S. Sibuyi, Mervin Meyer, Admire Dube and Mohammed O. Balogun (2020). Synthesis, physicochemical characterization, toxicity and efficacy of a PEG conjugate and a hybrid PEG conjugate nanoparticle formulation of the antibiotic moxifloxacin. RSC Adv., 2020, 10, 19770.

   2. Okasha, H. (2020). Interferon and p 53 Tumor Suppressor Marker in Hepatocellular Carcinoma. International Journal of Pharmaceutical Research, 12(02).

   3. Morsi, E. A., Ahmed, H. O., Abdel-Hady, H., El-Sayed, M., & Shemis, M. A. (2020). GC-analysis, Antioxidant, Anti-inflammatory, and Anticancer Activities of some extracts and fractions of Linum usitatissimum. Current Bioactive Compounds, 16.

   4. Hend Okasha, Safia Samir (2020): Synthesis and molecular cloning of antimicrobial peptide chromogranin A N-46 gene using conventional PCR. Gene Reports 18 (2020) 100571.

2019

1. 5. Khaled Mohamed Farid El Sehrawy, Mohamed Ali El-Dessouky, Sanaa Osama Abdallah, Moataz Hassan, Hanan Omar Hassanein, Mohamed Abbas Shemis, Mohamed Mahmoud Shaheen, Mohamed Ali Saber (2019). Correlation of Response of Pegylated Interferon and Ribavirin to Mutations in the Interferon Sensitivity-Determining Region and Internal Ribosome Entry Sites of HCV Genome Isolated from Egyptian Patients. Life Science Journal. 16 (1).

   6. AR Mashaal, M Abd El-Hameed, AA El Ray, MA Shemis, M Seyam (2019). Detection Of Occult Hepatitis C Virus Infection In Egyptian Patients Who Achieved A Sustained Virologic Response To Direct-Acting Antiviral Agents. Hepatology. 70, 921A-921A.

   7. Manal Diab, Dalia Salem, Ahmed El-Shenawy, Amira El-Far, Aya Abdelghany, Alaa Reda Awad, Inas El Defrawy, Mohamed Shemis (2019). Detection of high level aminoglycoside resistance genes among clinical isolates of Enterococcus species . Egyptian Journal of Medical Human Genetics. 20 (1), 28.

   8. Hend Okasha, Marwa Hassan, Tarek Aboushousha, & Safia Samir. (2019). Effect of Interferon-Beta (IFN-β) on tumor suppressor and apoptotic markers in hepatocellular carcinoma cell line. International Journal of Research in Pharmaceutical Sciences, 10(4), 2936–2943.

   9. Marwa T. A Abdel-Wareth, Ali M. El-Hagrassi, Mohamed S. Abdel-Aziz, Sami M. Nasr and Mosad A. Ghareeb (2019) Biological activities of endozoic fungi isolated from Biomphalaria alexandrina snails maintained in different environmental conditions. International Journal of Environmental Studies , 76:5, P 780:799.

   10. – Heba A. Hady, Eman A. El Wakil, Sami M. Nasr (2019). Characterization and Evaluation of Antimicrobial and Cytotoxic Activities of Glycine max Methanol Extract. International Journal of Pharmaceutical Research Vol 11 | Issue 2. P: 418:426.

   11. Amina M. Ibrahim and Sami M. Nasr (2019). Cytochrome oxidase subunit and internal transcribed spacer molecular revelation of infection with fasciola sp. in field- collected lymnaea natalensis snails. J. Egypt. Soc. Parasitol. (JESP), 49(2), 357 :364

   12. Shaaban R, El-Sayed WM, Samir S & El-Dabaa E (2019): Molecular and Biological Characterization of a Prepared Recombinant Human Interferon Alpha 2b Isoform. Applied Biochemistry and Biotechnology. 188 (1): 72-86

   13. Samar Ebrahim Abd El-Razek, Sabreen Mohamed El-Gamasy, Marwa Hassan, Mohamed S. Abdel-Aziz d, Sami Mohamed Nasr (2019). Transition metal complexes of a multidentate Schiff base ligand containing guanidine moiety: Synthesis, characterization, anti-cancer effect, and anti-microbial activity. Journal of Molecular Structure, Vol 1203, 127381.

2018

1. 14. Manal Diab, Mohamed Shemis, Doaa Gamal, Ahmed El-Shenawy, Maged El-Ghannam, Effat El-Sherbini, Mohamed Saber (2018). Helicobacter pylori Western cagA genotype in Egyptian patients with upper gastrointestinal disease. Egyptian Journal of Medical Human Genetics. 19, 297–300

   15. Manal Diab, Ahmed El-Shenawy, Mohamed Shemis, Maged El-Ghannam, Manal El Said, Moustafa Abdelnasser, Mahmoud Abdel-Hady, Effat El-Sherbini and Mohamed Saber (2018). Helicobacter pylori infection in egyptian patients with dyspepsia: diagnostic, demographic, endoscopic and clinical characteristics . Int. J. Adv. Res. 6(6), 226-234.

   16. Samah Mammdouh abdel-Hafiz, Hussam Mohamed Hamdy, Fatma EL-Zahraa Mohamed Khorshed, Tarek Salah El-Din Aboushousha, Gehan Safwat, Mohamed Ali Saber, Mohamed Ismail Seleem. (2018): Evaluation of Osteopontin as a Biomarker in Hepatocellular Carcinoma with Chronic HCV. Asian Pac J Cancer Prev, 19 (4), 1021-1027.

   17. Hala Farawela, Rabab Fouad, Nariman Zahran, Bothina Madkour, Zainab El-Saadany, Salaw Toimaa, Samah Mamdouh, Hisham El-Kiat. (2018): Fibronectin gene polymorphisms in HCV related type II mixed cryoglobulinemia: risk of development of B-cell lymphoma . Comparative Clinical Pathology . 27:1389–1395.

   18. Nasr SM, Ghareeb MA, Mohamed MA, Elwan NM, Abdel-Aziz AWA, Abdel-Aziz (2018) “MS. High-performance liquid chromatographyfingerprint analyses, In vitro cytotoxicity, antimicrobial and antioxidant activities of the extracts of two cestrum species growing in Egypt”. Phcog Res; 10:173-80.

   19.  Ghareeb M, Saad A, Ahmed W, Refahy L, Nasr S. (2018) “HPLCDAD- ESI-MS/MS characterization of bioactive secondary metabolites from Strelitzia nicolai leaf extracts and their antioxidant and anticancer activities In vitro“. Phcog. Res;10:368-78.

   20. Hala Badawi, Manal El Said, Safia Samir, Ahmed Ismail, Afkar Badawy, Ahmed Barakat. and Mohamed Saber (2018): Prevalence of Human Papillomavirus Genotypes among Egyptian Patients with Cancer Bladder. Journal of International Pharmaceutical Research. (45): 203-214.

   21. Hala Badaw, Mohammed Abass , Olfat Hamam , Manal Diab , Manal El Said , Ahmed Ismail, Gehan Mostafa , Safia Samir , Ehab El-Dabaa and Mohamed Saber (2018). Molecular and in-situ hybridiztion of human papiloma virus genotypes among Egyptian patients with bladder cancer. International journal of Pharmaceutical Research,10 (4): 402-411.

   22. Shaaban R, El-Sayed W M, & Samir S and El-Dabaa E (2018). Molecular and Biological Characterization of a Prepared Recombinant Human Interferon Alpha 2b Isoform. Applied Biochemistry and Biotechnology. https://link.springer.com/article/. DOI 10.1007/s12010-018-2908-y. ISSN 1559-0291.

2017

1. 23. Ahmed A. Hosni, A. Adel Abdel-Moneim , Eman S. Abdel-Reheim ,Samah M. Mohamed , Hamdi Helmy. (2017): Cinnamaldehyde potentially attenuates gestational hyperglycemia in rats through modulation of PPARɤ, proinflammatory cytokines and oxidative stress. Biomedicine & Pharmacotherapy, 88, 52-60.

   24. Tarek S. Aboushousha, Samah Mamdouh, Hussam Hamdy, Noha Helal, Fatma Khorshed, Gehan Safwat, Mohamed Seleem. (2017): Immunohistochemical and Biochemical Expressions Patterns of TTF-1, RAGE, GLUT-1 and SOX2 in HCV-Associated Hepatocellular Carcinoma. Asian Pac J Cancer Prev., 19(1), 219-227.

   25. Mohamed A Saber , Samah MM AbdelHafiz , Fatma E Khorshed , Tarek S Aboushousha , Hussam EM Hamdy , Mohamed I Seleem , Amira H Soliman (2017): Differential Expression of Glypican-3 and Insulin–Like Growth Factor-II mRNAs and Alpha-Fetoprotein and Ki-67 Markers in HCV Related Hepatocellular Carcinomas In Egyptian Patients. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 18: 121-127.

   26. Samah Mamdouh, Fatma Khorshed, Tarek Aboushousha, Hussam Hamdy, Ayman Diab. Mohamed Seleem, Mohamed Saber. (2017): Evaluation of Mir-224, Mir-215 and Mir-143 as Serum Biomarkers of HCV Associated Hepatocellular Carcinoma. Asian Pac J Cancer Prev., 18(11), 3167-3171.

   27. Ahmed El-Shenawy, Manal Diab, Mohamed Shemis, Maged El-Ghannam, Dalia Salem, Moustafa Abdelnasser, Mohamed Shahin, Mahmoud Abdel-Hady, Effat El-Sherbini, Mohamed Saber (2017). Detection of Helicobacter pylori vacA, cagA and iceA1 virulence genes associated with gastric diseases in Egyptian patients. Egyptian Journal of Medical Human Genetics.

   28. Soliman R.H., Ismail O.A., Badr M.S., Nasr S.M. (2017) “Resveratrol ameliorates oxidative stress and organ dysfunction in Schistosoma mansoni infected mice” Experimental Parasitology 174, 52-58.

   29.  Huda R. M. Rashdan, Sami M. Nasr, Heba A. El-Refai, Mohamed S. Abdel-Aziz (2017) “A Novel Approach of Potent Antioxidant and Antimicrobial Agents Containing Coumarin Moiety Accompanied with cytotoxicity studies on the Newly Synthesized Derivatives” Journal of Applied Pharmaceutical Science. Vol. 7 (07), pp. 186-196.

   30. Mohammed Ali Saber, Safia Samir El-Naggar, Moatz Hassen Hassanein and Ahmed Barakat barakat. (2017): Role of MxA and Neutralizing antibodies in early response to Interferon treatment in Hepatitis C Egyptian Patients. European Journal of Biomedical and pharmaceutical Sciences. 4(2): 84-94.

   31. Ahmed El-Shenawy, Manal Diab, Mohamed Shemis, Maged El-Ghannam, Dalia Salem, Moustafa Abdelnasser, Mohamed Shahin, Mahmoud Abdel-Hady, Effat El-Sherbini and Mohamed Saber (2017). Detection of Helicobacter pylori vacA, cagA and iceA1 Virulence Genes Associated with Gastric Diseases in Egyptian Patients. Egyptian Journal of Medical Human Genetics. https://doi.org/10.1016/j.ejmhg.2017.04.003

   32. Mohamed Saber, Hend Okasha Ahmed, Magdy Mahmoud Mohamed and Mahmoud Hassan Romeih. (2017): Production of recombinant human interferon gamma by batch fermentation in E.coli system. Arab Journal of Biotechnology. Vol. 20: 11-19.

2016

1. 33. Ahmed Mostafa Aref , Mohamed Shamrouh Othman, Samah Mamdouh, Ehab Dabaa, Moataz Hassanein, Mohamed Ali Saber. (2016): New Biomarkers for Response to Treatment of HCV Infected Patients Based on IP-10 and IL 28B Polymorphism Analysis. American Journal of Biochemistry. doi:10.5923/j.ajb.20160605.02.

   34. Walaa Mosaad, Dalia Ibrahim Ramadan, Mohamed Abbas Shemis (2016). Prevalence of mutations within major hydrophilic region of hepatitis B virus and their correlation with genotypes among chronically infected patients in Egypt. Arab Journal of Gastroenterology 47 17(1).

   35. Eman El-Ahwany, Faten Nagy, Mona Zoheiry, Mohamed Shemis, Mona Nosseir, Hoda Abu Taleb, Maged El Ghannam, Rafaat Atta, Suher Zada (2016). Circulating miRNAs as Predictor Markers for Activation of Hepatic Stellate Cells and Progression of HCV-Induced Liver Fibrosis. Electronic Physician 8(1): 1804-1810.

   36. Eman El-Ahwany, Faten Nagy , Mona Zoheiry , Maged ELGhannam , Mohamed Shemis , Mohamed Aboul- Ezz , Suher Zada (2016). The Role of MicroRNAs in Response to Interferon Treatment in Chronic Hepatitis C patients. Electronic Physician, 8(2): 1994-2000.

   37. Manal Diab, Mohamed Shemis, Maged El-Ghannam , Doaa Gamal , Magda Azmy , Dalia Salem , Soheir Mansy and Mohamed Saber (2016). Helicobacter pylori vacA genotyping in relation to cagA status, ultra-structure of gastric mucosa and clinical outcomes in Egyptian patients. African Journal of Microbiology Research, 10 (14): 465-472.

   38. Omar A. Tahaa, Heba k. abdelhakim, Zainab Zakariaa, Mohamed Shemis and Alaa Barakat (2016). Hypolipidemic and Anti-fatty Liver Effects Exerted by Pomgeranate (Punica granatum L., Lythraceae) Peel Extract in HepG2 cell-line and high-fat diet induced mice. International Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, (8) 6.

   39. Romeih M., Saber M., Mamdouh S., Khorshed F., Medhat A. (2016): Promising miRNA Biomarkers for Predicting the Response to the Interferon Combined therapy in HCV-4 Egyptian Patients. Arab J. Biotech., Vol.19,No. (2) July : 123-134.

   40. Saber Mohamed Ali, Mohamed Nadia Abdullah, Mohamed Eman Abd Al-Azeem and Okasha Hend Ahmed (2016). Isolation, molecular cloning and gene expression of human inerferon gamma (IFN-γ) gene in Escherichia coli. Journal of Pure and Applied Science. 54 (3): 1-7.

2015

1. 41. Samah Mamdouh, Ayman M. Metwally, Ahmed M. Aref, Hussein M. Khaled, Olfat Hammam, Mohamed A. Saber (2015): Bat-26 is Associated with Clinical Stage and Lymph Node Status in Schistosomiasis Associated Bladder Cancer. American Journal of Biochemistry. doi:10.5923/j.ajb.20150501.03.

   42. Samya El-shishtawy, Nevine Sherif, Emad Abdallh, Laila Kame, Mohamed A. Shemis, Abdel Aziz Ali Saleem, Haitham Abdalla, Hesham Gamal el Din (2015). Occult Hepatitis C Virus Infection in Hemodialysis Patients; Single Center Study. Electronic Physician, 7 (8): 1619-1625.

   43. Faten Z Mohamed, Mohamed A Shemis, Mona N Mohareb, Heba A Hosiny (2015). Studies on Nanoengineered Multilayer Capsules for Drug Delivery. Indian Journal of Novel Drug delivery, 7(2): 62-72.

   44. Saber M.A. , Moubasher M.H., Shaheen M.M., Mamdouh S. and Omar H. A. (2015): Human granulocyte colony stimulating factor (hG-CSF): cloning and expression in E. coli cells. Arab J. Biotech., Vol.18,No. (1) January : 45-54

   45. Sami M. Nasr, Mohamed K. Ibrahim, Hanaa A. Hammad, Hanan A. Omar, J.H. David Wu, Ryan Severins, Mohamed A. Saber (2015) “ Cloning and expression of Human Growth Hormone in E. coli System. Arab Journal of Biotechnology Vol. 18(1) January, P: 33-44.

2014

1. 45. Mona N. Moharib, Olfat A. Hammam, Fatma H. Salman, Mohammed M. El-naggar and Soad A. Sherif (2014): Transplantation of modified hepatocyte reduces hepatotoxicity induced by carbon tetrachloride. Life Science Journal. 11(8): 641-652.

   46. SaraMohamed Massoud, Mohamed Abbas Shemis, Ehab Aly Drees, Mamdoh Ahmed Taha, Hanan Abdelmoniem Omar, Mohamed Ali Saber (2014). Predicative Factors For Pegylated Interferon-Α Plus Ribavirin Combination Therapy In Egyptian Patients With Chronic Hepatitis C infected With Genotype 4. The Egyptian Journal of Biochemistry & Molecular Biology, 32 (N.2) 132-153.

   47. Soad A. Sherif , Mona N. Moharib, Naglaa M. El-lakkany, Olfat A. Hammam ,Fatma H. Salman and Mohammed M. El-naggar (2014): the use of microencapsulated hepatocytes transplantation reduces mortality and liver alteration in schistosoma mansoni infected hamsters. Journal of the Egyptian society of parasitiology. 44(1): 229-242.

2013

1. 48. SaberM, Diab T, Hammam O, Karim A, Medhat A, Khela M and El-Dabaa E (2013). Protective and Anti-Pathology Effects of Sm Fructose-1,6- Bisphosphate aldolase-based DNA vaccine against Schistosoma mansoni by changing route of injection. Korean J Parasitol., 51: 155-163.

   49. El Ray A, Asselah T, Moucari R, El Ghannam M, Taha AA, Saber MA, Akl M, Atta R, Shemis M, Radwan AS, Ghali A, Paradis V, Marcellin P. (2013). Insulin resistance: a major factor associated with significant liver fibrosis in Egyptian patients with genotype 4 chronic hepatitis C. Eur J Gastroenterol Hepatol., 25:421-7.

   50. Fam N, Gamal D, El Said M, Aboul-Fadl L, El Dabaa E, El Attar S, Sorur A, Fouad S and Klena J (2013). Detection of plasmid-mediated AmpC beta-lactamases in clinically significant bacterial isolates in a research institute hospital in Egypt. Life Science Journal, 10: 2294 – 2304.

   51. Fam N, Gamal D, El Said M, El Defrawy I, El Dabaa E, El Attar S, Sorur A, Ahmed S and Klena J (2013). Prevalence of plasmid-mediated ampC genes in clinical isolates of Enterobacteriaceae from Cairo, Egypt. British Microbiology Research Journal, 3: 525-537.

   52. Saad El Dine S, El Said M, El-Dabaa E, Abdel Raoof E, Raafat M, Nabil M, Hassanein M, Saber M, Omer M (2013). Occult Hepatitis B Virus Infection in Haemodialysis Egyptian Patients with Chronic Hepatitis C. Life Science Journal, 10: 237-245.

   53. Diab M, Fam N, El-Said M, El-Dabaa E, El- Defrawy I and Saber M (2013). Occurrence of VIM-2 Metallo-ß- Lactamases in imipenem resistant and susceptible Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Egypt. African Journal of Microbiology Research, 7: 4465-4472.

   54. Ahmed El Ray, Tarik Asselah, Rami Moucari, Maged El Ghannam, Alaa A. Taha, Mohamed A. Saber, Maha Akl, Raafat Atta, Mohamed Shemis, Azza S. Radwan, Ayman Ghali, Valerie Paradis and Patrick Marcellin (2013). Insulin Resistance: A Major Factor Associated With Significant Liver Fibrosis in Egyptian Patients with Genotype 4 Chronic Hepatitis C. European Journals of Gastroenterology & Hepatology 25 (4): 421-427.

   55. Saber M A, Omar H A, Shemis MA, El-Dabaa E, Hassan HM, Moharib MN, Abou-Shousha TS and Romeih MH (2013). Evaluation of the immune response induced by DNA vaccine cocktail expressing Schistosoma mansoni genes. Arab Journal of Biotechnology, 15: 157-172.

2012

1. 56. Aitta AA, El Said M, El Dabaa E, El Salam MA and Hesham MM (2012). Detection of Plasmid-Mediated 16S rRNA Methylase Conferring High-Level Resistance to Aminoglycosides in Gram negative bacilli from Egypt. Life Science Journal. 9 (4 ): 2472-2479.

   57. Khattab RA, Rasmy SA, Ragab YM, Said DG, Abdelfatah MM, Shemis MA, Ezzat DM and Abdel Rahman FS (2012). Evaluation of Polymerase Chain Reaction and Culture for the Diagnosis of Corneal Ulcer. Life Science Journal, 9:746-755.

   58. Shemis MA, El-Abd DM, Ramadan DI, Mohamed, El-Sayed I, Guirgis BS, Saber MA, Azzazy HM. (2012). Evaluation of Multiplex Nested Polymerase Chain Reaction for Routine Hepatitis C Virus Genotyping in Egyptian Patients. Hepat Mon., 12:265-70.

   59. Rania A. Khattab, Salwa A. Rasmy, Yasser M. Ragab, Dalia G. Said, Maha M. Abdelfatah, Mohamed A. Shemis, Dalia M. Ezzat and Fatma Elzahraa S. Abdel Rahman (2012). Evaluation of Polymerase Chain Reaction and Culture for the Diagnosis of Corneal Ulcer. Life Science Journal 9(3)746-755.

   60. Evaluation of the immune response induced by DNA vaccine cocktail expressing Schistosoma mansoni genes (2012). Saber M. A., OmarH. A., ShemisM. A., El-Dabaa E., HassanH. M., MoharibM. N., Abou-Shousha T.S. and RomeihM. H.ArabJ.Biotech.Vol.15, No. (2):157-172.

2011

1. 61. Xie Q, Wondergem R, Shen Y, Cavey G, Ke J, Thompson R, Bradley R, Daughtery-Holtrop J, Xu Y, Chen E, Omar H, Rosen N, Wenkert D, Xu HE, Vande Woude GF (2011). Benzoquinone ansamycin 17AAG binds to mitochondrial voltage-dependent anion channel and inhibits cell invasion. Proc Natl Acad Sci U S A. 108:4105-10.

   62. Mostafa MS, El-Seidi EA , Kassem A, Shemis M, Saber M, Michael MN. (2011). Detection of ascitic fluid infections in patients with liver cirrhosis and ascites. Arab Journal of Gastroenterology, 12:20–24.

   63. Almahdy O, EL-Fakharany EM, EL-Dabaa E, Tzi Bun Ng , Redwan EM (2011). Examination of the Activity of Camel Milk Casein against Hepatitis C Virus (Genotype-4a) and Its Apoptotic Potential in Hepatoma and HeLa Cell Lines. Hepat Mon, 11:724-730.

   64. Saber M, Essmat G, Shaaban R, Khalifa MH and El-Dabaa E (2011). Incidence of anti- Interferon-α2 antibodies in Egyptian HCV infected patients treated with peg-IFN-α2 and Influence on Response to treatment. New Egyptian Journal of Medicine, 44: 30-38.

   65. Saber M.A, Abdallah SO, Mabrouk ME, El Sehrawy FE , Shaheen M and Romeih MH (2011). Identification of genotypes and subtypes of Hepatitis C Virus in the Blood of Egyptian infected patients. Arab J Biotech, 14:1-12

2010

1. 66. Badawi H, Ahmed H, Aboul Fadl L, Helmi A, Fam N, Diab M, Ismail A, Badawi A, Saber M (2010). Herpes simplex virus type-2 in Egyptian patients with bladder cancer or cystitis. Acta Pathologica, Microbiologica, Et Immunologica Scandinavica [APMIS],118: 37-44.

   67. Elattar G, Saleh Z, EL-Shebini S, Farrag A, Zoheiry M, Hassanein A, EL-Ghannam M, Shendy S, EL-Dabaa E, Zahran N (2010). The use of whey protein concentrate in management of chronic hepatitis C virus – a pilot study. Arch Med Sci., 6 : 748- 755.

   68. Saber M., Hammad H., El-sherif S., Shabaan R., Nassar M, Nasr S., Okasha H., El-Dabaa E. (2010): “Lab scale production of recombinant pharmaceutical proteins established skills for R&D and innovative research” 3rd Stakeholders Meeting of the African Network for drugs and Diagnostics Innovation 11-13 October 2010 United Nations Office in Nairobi UNON, Kenya.p:119

   69. Ghreeb A., Saber M. A., Nasr S.,”Cloning of Human growth hormone HGH in TA cloning vector (2010): 5^th Scientific Environmental Conference Faculty of Science, Zagazig University 19 may. P: 49:58

   70. Herpes simplex virus type-2 in Egyptian patients with bladder cancer or cystitis (2010). Badawi H, Ahmed H, Aboul FadlL, Helmi A, Fam N, Diab M, Ismail A, Badawi A, Saber M. APMIS. 118(1):37-44.