قسم الميكروبيولوجى

يعتبر معمل الميكروبيولوجي أحد المختبرات الحيوية في معهد تيودور بلهارس للأبحاث، حيث يهتم بتشخيص أهم الميكروبات المعدية واختيار المضادات الحيوية المناسبة للميكروبات و لجميع المرضى الذين يترددون على عيادات المعهد الخارجية بالإضافة إلى مرضى الأقسام الداخلية للمستشفى. حيث يستقبل معمل عيادة الميكروبيولوجي عينات إكلينيكية مختلفة من المرضى لأداء اختبارات المزارع والحساسية للميكروبات. كما يقوم المعمل بإجراء فحوصات سيرولوجية لتشخيص الأمراض الفيروسية الكبدية.

يجمع المختبر بين الأساليب التقليدية والآلية في النشخيص و التي تسمح بعلاج عدوى بكتريا الدم في مرحلة مبكرة من خلال التعرف الآلي والحساسية للبكتيريا أو الفطريات المعزولة. بالإضافة إلى الكشف الآلي عن المؤشرات الحيوية الهامة لعدوى بكتريا الدم.

كما يهتم  المعمل بتحديد البكتيريا المعدية المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية والجينات المقاومة لها وإجراء أبحاث علمية مبتكرة لمعالجة المشكلة العالمية  لمقاومة المضادات الحيوية باستخدام أحدث تقنيات في التشخيص في  مجال البيولوجيا الجزيئية.

أن تساهم السياسات والأبحاث التطبيقية لعلم الميكروبيولوجيا في التغلب على تحديات الأمراض المعدية وظهور الميكروبات المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية.

• الخدمة – يتمثل الدور الأساسي لمعمل الميكروبيولوجي في تحديد العوامل المسببة للأمراض المعدية المختلفة وإستخدام المضادات الحيوية المناسبة في العدوى البكتيرية و يتم ذلك بطريقة فعالة من حيث التكلفة والسرعة في تقديم الخدمة التشخيصية بما يتيح رعاية جيدة وفعالة للمرضى.
• التدريس – تعليم الاستخدام المناسب للاختبارات المعملية التشخيصية في رعاية المرضى من خلال رفع مستوى الأداء الفني والخلفية العلمية  للأطباء و المبتدئين.
• البحث – تطوير وتقييم الإجراءات والبروتوكولات التي تدعم وتعزز وتوسع قدرة المعمل في تقديم طرق حديثة وأكثر فاعلية في التشخيص ومكافحة الميكروبات المقاومة للمضادات الحيوية.

أ.د. دعاء جمال دسوقي

البريد الإلكتروني: [email protected]

رؤساء القسم السابقين وأعضاء القسم

• رؤساء القسم السابقون

أ.د. عفت محمود الشربيني (1990 – 1993 و 2000 – 2003)

المرحومة أ.د. سعاد مختار (1993 – 2000)

أ.د. عائشة أبو عيطة (2003-2009)

أ.د. إيناس إمام الدفراوي (2009-2015)

أ.د. هالة السيد بدوي (2015-2017)

أ.د. منال سعد دياب (2017-2018)

أ.د. نيفين فام (2018-2020)

• أعضاء القسم:

أ.د. مايسة محمد عمر

أ.د. سماح سعد الدين

أ.د. ليلى ابو الفضل

أ.د. هدى حلمي

أ.د. منال السعيد السيد

استاذ مساعد داليا عادل عبد اللطيف

المدرس ناهد يحيى اسماعيل

المدرس أميرة طلال الفار

المدرس هبة مصطفى دحروج

المدرس احمد مصطفى الشناوى

المدرس المساعد غادة علي

المدرس المساعد رانيا الغرباوي

المدرس المساعد منار خالد رزق

المدرس المساعد نهى يسري

المدرس المساعد نهى رفعت

المدرس المساعد ريهام مجدي وصفي

المدرس المساعد منار عفت

الأخصائية رانيا مهدي الجابري

الأخصائية بسمة طارق

يرتكز العمل البحثي الحالي على أربع فئات رئيسية :

أ. الكشف عن البكتيريا  المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية: تشمل العزلات المعوية وعزلات بكتيريا الأسينيتوباكتر المقاومة للكاربابينيم بالإضافة إلى المقاومة في جرثومة المعدة البكتيريا الحلزونية.

ب. دراسة تأثير المضادات الحيوية الحديثة والقديمة  التي يعاد إستخدامها مثل عقارات ” الكولستين و الفوسفومايسين  ” في علاج العدوى الناتجة عن   البكتيريا  المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية مثل البكتيريا المعوية وبكتيريا الأسينيتوباكتر.

ج. التشخيص السريع لتسمم الدم : دور الدلالات الحيوية للتسمم الدموي CRP- presepsin) procalcitonin) في تشخيص و متابعة مرضى الصدمة التسممية

د. الطرق التشخيصية الحديثة للكشف عن مسببات الأمراض المتوطنة الناشئة عن عدوى جرثومة المعدة الحلزونية (H. pylori)  ,Chlamydia, Mycoplasma ,Candida spp .وكذلك أستخدام جزئيات النانو كوسيلة مستحدثة  في العلاج بالمضادات الحيوية.

تم تصميم سياسة المختبر لتلبية احتياجات المرضى في المستشفى والمرضى المترددين على العيادات الخارجية ، لذا فإن الخدمات تشمل تحديد البكتريا المسببة للعدوى وعمل اختبار الحساسية للمضادات الحيوية من  العديد من الإصابات ؛

• التهابات المسالك البولية.
• أمراض الإسهال.
• التهابات مجرى الدم.
• حمى مجهولة المصدر.
• العدوى المرتبطة بالأجهزة والإجراءات الطبية.
• التهابات ما بعد الجراحة وتسمم الدم
• الالتهابات المتعلقة بضعف المناعة لدى مرضى الكلى و الإلتهاب الكبدي المزمن.
• الالتهاب الرئوي.
• السل.
• الالتهابات الفيروسية.
• الالتهابات الفطرية.

يتم تحقيق خدمة علم الأحياء الدقيقة من خلال عدة تقنيات تشغيل :

• صبغات الجرام و أخرى خاصة ببكريا الدرن
• الفحص المجهري للبول
• مزرعة وحساسية البول
• مزرعة وحساسية البصاق
• مزرعة مسحة الحلق والحساسية
• مزرعة من الصديد
• مزرعة الدم
• مزرعة وحساسية السوائل البيولوجية عدا البول و الدم مثل سائل الأستسقاء.
• مزرعة الفطريات والحساسية آليا بواسطة VITEK 2.
• المزارع اللاهوائية عند الطلب.
• اختبارات التيوفود و البروسيلا.
• الكشف النوعي عن CRP بواسطة تراص اللاتكس.
• الكشف الكمي لـ CRP آليا.
• دلالات الفيروسات (HBsAg، HCV Ab) يدويا ELISA و آليا باستخدام جهاز ال VIDAS.
• تحديد العلامات الحيوية المبكرة لتسمم الدم البروكالسيتونين (PCT) بواسطة نظام VIDAS
• الكشف السريع عن انتيجينات جرثومة المعدة في البراز

يتكون المعمل من 4 مختبرات بحثية ومختبر عيادة خارجية مجهز بالمرافق الأساسية للإختبارات الميكروبيولوجية:

مختبر عمل المزارع و الحساسيات

• المزارع البكتيرية الروتينية على أوساط الميكروبيولوجية المختلفة.
• الطريقة الروتينية لعمل حساسيات للعزلات السرسرية أو آليا عن طريق نظام Vitek 2.
• زراعة الدم وسوائل الجسم الأخرى بواسطة أنظمة آلية ( Bact / Alert 3D أو BACTEC 9050).

مختبر السيورلوجي

• الكشف عن الأجسام المناعية و دلالات الفيروسات يدويا بواسطة تقنية ELISA و آليا باستخدام جهاز التحليل المناعي VIDAS .
• الكشف عن مؤشرات التسمم في الدم البروكالسيتونين بواسطة جهاز التحليل المناعي VIDAS و CRP آليا بواسطة محلل البروتين الآلي.

معمل البيولوجيا الجزيئية

• استخلاص الحمض النووي بطريقة الغليان بالطرق التجارية.
• استخدام اختبار البلمرة المتسلسل (PCR)
• الكشف عن الجينات المقاومة لمضادات الحيوية
• متابعة تفشي العزلات البكتيرية باستخدام اختبار الفصل الكهربي باستخدام الحقل النابض  (PFGE) .

التدريب في التقنيات الميكروبيولوجية الروتينية متاح بشكل دوري في شكل:

• برنامج التدريب السنوي الصيفي على أحدث طراز في تشخيص الأمراض المعدية للمتدربين من كليات علوم و صيدلة و من الراغبين من أعضاء المعامل الأخرى بالمعهد.
• برنامج تناوب لطلاب الطب الجامعيين وأعضاء هيئة التدريس و معاونيهم في معمل العيادة الخارجية.
• التدريس السنوي لدورة علم الأحياء الدقيقة لطلاب مدرسة التمريض.

تتمثل في مشاريع بحثية سواء تم الانتهاء منها بالفعل أو قيد التنفيذ في المواضيع التالية:

أ. دراسات بيتا لاكتاماز في البكتيريا سالبة الجرام:

• الكشف والتوصيف الجزيئي لمختلف الإنزيمات المسؤولة عن مقاومة المضادات الحيوية من البيتالاكتاميز في العزلات السريرية البكتيرية المصرية المقاومة للأدوية المتعددة سلبية الجرام.
• التشخيص الظاهري والجيني للبكتيريا السالبة الجرام المقاومة للمضادات الحيوية مثل البيتا لاكتاميز و البكتيريا المقاومة للكاريابينم.
• الكشف الظاهري عن البكتيريا المعوية المقاومة للأدوية المتنوعة بإستخدام وسائل تشخيصية سريعة وبسيطة للكشف عن ESBLs, MBLs, AmpC في مختلف العينات الإكلينيكية من مرضى المسنشفى والمترددين على العيادات الخارجية للمعهد.
• كشفت دراسة مقارنة بين مستشفى معهد تيودور بلهارس للأبحاث بمصر و مستشفى بوجون بفرنسا وجود البكتريا المعوية المنتجة للبيتالاكتاميز ممتد المفعول في براز مرضى الكبد وأن انتشارها في براز المرضى المصريين كان مرتفعا (77.5٪) مقارنة بـ 6.5٪ من المرضى في فرنسا. وأن أكثر من 50٪ من المرضى المصريين لم يكن لديهم تاريخ من دخول المستشفى سابقًا ، مما يشير إلى ارتفاع معدل انتشار ESBL في المجتمع في مصر.
• تهدف المشاريع الجارية لدراسة مقاومة البكتيريا المعوية وبكتيريا الأسينيتوبكترلعقار الكاربابينيم في حالات العدوى البكتيرية و حالات الإستعمار البكتيري بالإضافة إلى تقييم خيارات العلاج المتاحة. حيث أسفرت الأبحاث عن ارتفاع نسبة الإصابة والإستعمار بالميكروبات المنتجة للكاربابينيماز في مستشفى معهد تيودور للأبحاث مما يحد من الخيارات علاجية المتاحة  ويؤكد الإنتشار السريع في المجتمع.

ب . تقييم  معدلات عوامل الضراوة بالبكتيريا الحلزونية المعزولة من مرضى عسر الهضم:

• عدوى الجرثومة الحلزونية منتشرة بشكل كبير في مصر بين مرضى عسر الهضم وقد تم التأكد من إصابة 53.1٪ بالجرثومة الحلزونية.
• كما تم الكشف عن جينات الضراوة و التعرف على أنواع مختلفة من النمط الجيني عن طريق إختبار تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). وقد تم رصد الجينات الطافرة التي تمنح مقاومة لمختلف المضادات الحيوية التي عادة ما تستخدم في العلاج.

ج. دراسة الأغشية الحيوية والالتهابات المرتبطة بالقساطر:

• تم الكشف عن حالات العدوى المصاحبة في 55٪ من المرضى الذين لديهم أجهزة تداخلية ، وكانت المزارع إيجابية بالنسبة لـ 65٪ من جميع الأجهزة التداخلية. و كانت التركيزات المثبطة الدنيا للمضادات الحيوية المختلفة ضد الخلايا داخل الأغشية الحيوية أعلى بعشرة أضعاف من تلك الموجودة في العوالق.

د. عوامل إلتهاب الكبدي الفيروسي الناشئة في المرضى الذين يعانون من أمراض الكبد المزمنة وسرطان الخلايا الكبدية:

• العدوى الخفية بفيروس الإتهاب الكبدي B قد تزيد من شدة العدوى المزمنة بالفيروس وتسرع من التطور إلى تشمع الكبد وتعزز التطور إلى السرطان الكبدي. كما تمثل تقنية الرنين الكهربي الكمي المطورة حديثًا تطورًا كبيرًا كبديل للتقنيات الجزيئية لفحص وتشخيص عدوى فيروس الإلتهاب الكبدي الوبائي Bالخفي.
• العدوى بفيروسات كبدية أخرى مثل TTV و GBV-C و SEN-V لا تساهم في شدة الإلتهاب الكبدي لدى المرضى المصابين بفيروس الإلتهاب الكبدي C ولا في التسبب في سرطان الكبد.

ه. دور الالتهابات الفيروسية في تسرطن المثانة:

الارتباط الكبير بين CMV و HSV-2 و HPV-16 و -18 و -52 بسرطان المثانة في مرضى البلهارسيا المصريين يدعم بقوة فرضية العمل التآزري الفيروسي في تسرطن المثانة.

و. الكشف عن الأجسام المضادة لفيروس الورمالحليمي البشري (HPV) :

إستخدام أساليب مطورة للكشف السريع والدقيق للتشخيص المبكر لاثنين من الفيروسات السرطانية المنتشرة في المثانة (HPV- 16 ،  HPV-18).

1. Samir, S., El-Far, A., Okasha, H., Mahdy, R., Samir, F., Nasr, S.( 2022). Isolation and characterisation of lyrics bacteriophages from sewage at an Egyptian tertiary care hospital against methicillin resistant Staphylococcus aureus clinical isolates. Saudi. J.Biol. Sci 3097-3106. https://doi.org/10.1016/j.sjbs.2022.03.01
2. El-Defrawy, I., Gamal, D., El-Gharbawy, R. et al. (2022). Detection of intestinal colonization by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) among patients admitted to a tertiary care hospital in Egypt. Egypt J Med Hum Genet 23, 83. https://doi.org/10.1186/s43042-022-00295-9.
3. El-Far A, Samir S, El-Gebaly E, Omar M, Dahroug H, El-Shenawy A, Soliman NS, Gamal D (2021). High rates of aminoglycoside methyltransferases Associated with Metallo-Beta-Lactamases in Multidrug-Resistant and Extensively Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates from a Tertiary Care Hospital in Egypt. Infect and Drug Resist 2021:14 4849–4858. DOI:  https://doi.org/10.2147/IDR.S335582
4. El-Far A, Samir S, El-Gebaly E, Taha NY, Fahmy EM, Diab TM, El-Shenawy A. (2021). Assessment of eugenol inhibitory effect on biofilm gene expression in methicillin resistant Staphylococcus aureus clinical isolates in Egypt. Infection, Genetics and Evolution.89: 104722.
5. El-Shabrawy R M, GawishA A, AbdelazizElgabryR M, Nasr F M, Diab M, Gamal D (2021). Presepsin, procalcitonin and C-reactive protein as diagnostic biomarkers of sepsis in intensive care unit patients. Microbes and Infectious Diseases. 2(1): 119-129.
6. Gamal D, Egea P, Elías C, Fernández-Martínez M, Causse M, Pérez-Nadales E, Salem D, Fam N, Diab M, AbuAitta A, El-Defrawy I, Martínez-Martínez L(2020).High risk clones and novel sequence type ST4497 of Klebsiella pneumoniae clinical isolates producing different alleles of NDM-type and other carbapenemases from a single tertiary-care centre in Egypt. International Journal of Antimicrobial Agents. doi:10.1016/j.ijantimicag.2020.106164.
7. Fam N S, Gamal D, Mohamed S H, Wasfy R M, Soliman M S, El-Kholy A A, Higgins P (2020).Molecular Characterization of Carbapenem/Colistin Resistant Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from Egypt by Whole Genome Sequencing. Infect Drug Resist. 2020;13:4487-4493.https://doi.org/10.2147/IDR.S288865.
8. Fam N S, Mohamed S H, Gamal D, Wasfy R M, Soliman M S, El-Kholy A A(2020). Reliability of Phenotypic Methods for Detection of Colistin Resistance among Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from Egypt. Germs. 28;10(4):303-309. doi: 10.18683/germs.2020.1222. PMID: 33489945; PMCID: PMC7811857.
9. Gamal D, Salem D, Fernández-Martínez M, Abdelkhalek A, and El-Defrawy I (2019). Colonization with OXA-23 and NDM Positive Clonally Related Carbapenem Resistant Acinetobacter baumannii in ICU Patients from Egypt. International Journal of Pharmaceutical Research.11 (3):331-337.
10. Fam N, Gamal D, Salem D, Dahroug H, Wasfy R, Morcos M (2019). Clonal Diversity and High Prevalence of Oxa-23 among Carbapenem Resistant Acinetobacter baumannii Isolates in Egypt. Journal of Bioscience and Applied Research. 5(1): 110 -124.
11. Fam N, Dahroug H, El Far A, El Said M, Gamal D (2019). Efficacy of colistin combination with tigecycline or doripenem against carbapenem resistance Acinetobacter baumannii in relation to bla_OXA-23 and bla_NDM carbapenem resistance genes. Kasmera Journal.47(2): 2-14.
12.  El Said M, Dahroug H, El Shenawy A, El Far A (2019). Detection of inducible clindamycin resistance phenotypic and erm genes among clinical isolates of Staphylococci. Kasmera Journal. 47(2): 2-16.
13. Diab M, Salem D, Elshenawy A, El Far A, Abdelghany A, RedaAwad A, El Defrawy I, Shemis M (2019). Detection of high level aminoglycoside resistance genes among clinical isolates of Enterococcus species. Egyptian journal of medical human genetics. 28 (2019).
14. Ahmed N, Rizk D E, El Said M, Barwa R M F, Adel Elsokary M, Hassan R H I (2019). Molecular Identification and Virulence Factors Determination in Candida Species Isolated from Egyptian Patients. American Journal of Microbiological Research. 7(4):108-117.
15. Diab M, El-Shenawy A, El-Ghannam M, Salem D, Abdelnasser M, Shaheen M, Abdel-Hady M, El-Sherbini E, Saber M (2018). Detection of antimicrobial resistance genes of Helicobacter pylori strains to clarithromycin, metronidazole, amoxicillin and tetracycline among Egyptian patients. The Egyptian Journal of Medical Human Genetics. 19: 417–423. www.sciencedirect.com
16. Diab M, El-Shenawy A, Shemis M, El-Ghannam M, El Said M, Abdelnasser M, Abdel-Hady M, El-Sherbini E and Saber M (2018).Helicobacter pylori infection in Egyptian patients with dyspepsia: diagnostic, demographic, endoscopic and clinical characteristics. Int. J. Adv. Res. 6(6): 226-234.www.journalijar.com
17. Diab M, Shemis M, Gamal D, El-Shenawy A, El-Ghannam M, El-Sherbini E, Saber M (2018). Helicobacter pylori Western cagA genotype in Egyptian patients with upper gastrointestinal disease. The Egyptian Journal of Medical Human Genetics, 19: 297-300. www.sciencedirect.com
18. Mohamed S H, Salem D, Azmy M, Fam N S (2018). Antibacterial and antibiofilm activity of cinnamaldehyde against carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in Egypt: In vitro study. Journal of Applied Pharmaceutical Science. 8(11):151-156, www.japsonline.com
19. Zaiton M, Saad EL Din S, Abd EL- Hamid N, Salem D, EL Sheikh S (2018). Rapid Detection of Extended Spectrum β –Lactamases (ESBL) and their CTX-M Genetic Characterization. International Journal of Advanced Research (IJAR). 6 (7): 60-68.
20. El-Badry AA, Aufy S M, El-Wakil E S, Rizk E M, Mahmoud S S, Taha N Y (2018).  First identification of Naegleria species and Vahlkampfiaciguana in Nile water, Cairo Egypt: Seasonal morphology and phylogenetic analysis. Journal of microbiology, Immunology and Infection. http://www.japsonline.com
21. Badawi H, El-Said M, Samir S, Ismail A, Badawy A, Barakat A, and Saber M A (2018). Prevalence of Human Papillomavirus genotypes among Egyptian patients with cancer bladder. Journal of International Pharmaceutical Research. 45: 203-214.
22. Abd El Salam M, Gamal D, El Said M, Salem D, Abu Aitta A and El Gamal M S (2018). Prevalence of Plasmid-Mediated Quinolone Resistance in Multidrug-Resistant Gram Negative Bacilli in Egypt. Biomedical & Pharmacology Journal. 11(4):1927-1936.
23. Badawi H, Abass M, Hamam O, Diab M, El Said M, Ismail A, Badawy A, Mostafa G, Samir S, El-Dabaa E, Saber M (2018). Molecular and In-Situ Hybridization Detection of Human Papillomavirus Genotypes among Egyptian Patients with Bladder Cancer. International Journal of Pharmaceutical Research. 10(4):402-411.
24. Fam N, Gamal D, Azmy M, Wasfy R, Aboul-Fadl L, Badr M, El-Damarawy M (2017). Antimicrobial Efficacy of Doripenem Colistin Combination on Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Isolates by E-test Agar Dilution and Ultrastrastructural Methods. Egypt. J. Med. Microbiol. 26 (1): 1-7.
25. Aguirre-Quiñonero A, Cano M, Gamal D, Calvo J, Martínez-Martínez L (2017). Evaluation of the carbapenem inactivation method (CIM) for detecting carbapenemase activity in Enterobacteria”. Diagnostic Microbiology and Infectious Diseases; 88(3): 214-218.
26. El-Shenawy A, Diab M, Shemis M, El-Ghannam M, Salem D, Abdelnasser M, Shahin M, Abdel-Hady M, El-Sherbini E, Saber M (2017).  Detection of Helicobacter pylori vacA, cagA and iceA1 virulence genes associated with gastric diseases in Egyptian patients. The Egyptian Journal of Medical Human Genetics;18: 365-371.
27. Badawi H, El-Said M, Helmi A, Azmy M, Riad E, Beshr M and Helmi O (2016). Detection of Biological Nanoparticles and Their Association with Aluminium and Bariumin in Serum, Urine and Renal Stone in Egyption patients with Urolithiasis. Ciência e TécnicaVitivinícola31(2):254-223.
28. Diab M, Shemis M, El-Ghannam M, Gamal D, Azmy M, Salem D, Mansy S and Saber M (2016).  Helicobacter pylori VacA genotyping in relation to cagA status, ultra-structure of gastric mucosa and Clinical Outcomes in Egyptian Patients. AJMR.10(14): 465-472.
29. Gamal D, Fernández-Martínez M, Salem D, El-Defrawy I, Álvarez Montes L, Ocampo-Sosa AA, Martínez-Martínez L (2016). Carbapenem–resistant Klebsiella pneumoniae isolates from Egypt containing bla_NDM-1 on IncR plasmids and its association with rmtF. Int. J. Infect. Dis. 43: 17-20.
30. Badawi H, El-Said M, Helmi A, Hassan M, Elansarey M, Hazem A, Azmy  M and Helmi O (2016). Role of Nanoparticles in Egyptian patients with Biliary Lithiasis and Their Association with Aluminium and Barium in Serum and Urine”.Ciência e TécnicaVitivinícola. 31(4): 31(4):162-177
31. Gamal D, Fernández-Martínez M, El-Defrawy I, Ocampo-Sosa AA and Martínez-Martínez L (2016). First identification of NDM -5 associated with OXA-181 in Escherichia coli from Egypt. Emerging microbes and infection journal. 5(4): e30; doi:10.1038/emi.2016.24.
32. Azmy M, Ghanem L, Kassem F, Gamal D, Abdelkhalek A, El-Kholy E, Abo ELEneen M (2016). Scanning Electron Microscopy Biofilm Grading and Ventilator Associated Pneumonia in Relation to Duration of Intubation. Egypt. J. Med. Microbiol. 25(3): 81-88.
33. EL-Far A , Azza B, Saad El-Din S, Omar M, Ibrahim ZA, EL-Ghannam M,   EL-Dabaa E (2016).Laboratary Diagnosis of C. difficle Infection. Egypt. J. Med. Microbiol.   25(3).
34. EL-Far A , Azza B, Saad El-Din S, Omar M, Ibrahim ZA, EL-Ghannam M,   EL-Dabaa E (2016). Detection of Clostridium Difficile from Faecal Specimens of Hospitalized Patients in Theodor Bilharz Research Institute. Egypt. J. Med. Microbiol. 25 (3).
35. Elsayed NY, Awad AMR, Omar MM and Desouki DG (2015). Rapid Simultaneous detection of AmpC and ESBLs among Enterobacteriaceae using MastD68C detection set and possible therapeutic options. J. Med. Microbiol.24 (3): 1-12.
36. Radwan A, El-Defrawy I, El Sherbini E, Stefani A, Ghinolfi D, Desimone P, Filipponi F, Botros S (2014). Essential framework and strategic actions to establish North African medical research institute; Theodor Bilharz Research Institute (TBRI); as competence centers in liver research L management. 5 (7):35-43.
37. Sayed HA, El-Desouki H, El-Qareh N, Abdelwadoud M, El-Sherbini E, El-Defrawy I, Fam N, Siyam M, El-Khayat H, Lawrance O, Radwan A, Sabry Y, Stefani A, Desimone P, Ghinolfi D, Filipponi F, Botros S (2014). Analysis of national liver disease state of the art in North African Country (Egypt): Identifying gaps and priority needs to reshape liver disease problem and promote Euro Mediterranean co-operation. JETEAS. 5 (5) 159-163.
38. Fam NS, Defasque S, Bert B, Leflon-Guibout V, El-Ray A, El Ghannam M, Attia ME, Omar M, Desouki DG, Valla D, Nicolas-Chanoine MH (2014).Faecal carriage of extended spectrum β-Lactamases (ESBL) –producing enterobacteria in liver disease patients from two hospitals in Egypt and France: a comparative epidemiological study, Epidemiol. Infect.(7): 1-9.
39. Badawi H, Abu Aitta A, Omar M, Ismail A, Mohamed H, El Said M, Gamal D Saber M (2014). Novel Simple Diagnostic Methods Compared to Advanced Ones for the Diagnosis of Chlamydia trachomatis, Ureaplasmaurealyticumand Mycoplasmas hominis in patients with Complicated Urinary Tract Infections. AJMR 8(8):830-838.
40. Badawi H, El Damarawy M, Atteya A, Bastawesy R, El Said M, Helmy A, HelmyO, Ismail E (2014). Detection of biological nano-Particles in Egyptian patients with coronary artery disease. Life Sci. J.11(2): 258-268
41. Abu Aitta A, El Said M, Gamal D, El-Kholy A, Omar M, Kamel M, Mohamed H. (2013).Biotyping and molecular characterization of Klebsiella pneumoniae producing extended-spectrum beta-lactamase in Cairo, Egypt: a multicentre study.Res. J.1-11;5(9) 
42. Fam N, Gamal D, El Said M, El-Defrawy I, EL- Dabaa E, EL Attar S, Sorour A, Ahmed S and Klena J (2013). Prevalence of plasmid- mediated amp C genes in clinicalisolates of Enterobacteriaceae from Cairo, Egypt. BMRJ3(4):525- 537.
43. Fam N, Gamal D, El-Said M, Aboul –Fadl L, EL- Dabaa E, EL Attar S, Sorour A, Fouad S, and Klena J. (2013). Detection of plasmid mediated Amp C beta- lactamas in clinically significant bacterial isolates in a research institute hospital in Egypt. Life Sci. J. 10(2):2294-2304
44. Abu Aitta A, El- Said M, El – Dabaa E, Abd El-Slam M, Mahdy H (2013). Detection of plasmid-mediated 16S rRNA methylase conferring high-level resistance to aminoglycosides in Gram negative bacilli from Egypt. Life Sci. J.9(4):2472- 2479
45. Diab M, Fam N, El- Said M, El-Dabaa E, El- Defrawy I and Saber M (2013). Occurrence of VIM-2 metallo-β- lactamases in imipenem resistant and susceptible Pseudomonas aeruginosa clinical isolates from Egypt. AJMR 7(35):4465-72.